Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms