Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rprd1bQ9CSU0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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