Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms