Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700129C05RikQ9CQ77 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms