Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms