Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms