Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms