Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb1Q9CPU1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms