Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms