Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms