Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Mrpl3Q99N95 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl3Q99N95 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms