Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ms4a8Q99N10 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ms4a8Q99N10 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ms4a8Q99N10 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ms4a8Q99N10 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ms4a8Q99N10 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ms4a8Q99N10 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ms4a8Q99N10 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ms4a8Q99N10 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ms4a8Q99N10 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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