Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms