Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pagr1aQ99L02 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms