Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lactb2Q99KR3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lactb2Q99KR3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms