Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Ciao1Q99KN2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Ciao1Q99KN2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms