Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxp3Q99JB6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms