Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms