Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms