Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms