Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps4aQ8VEJ9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps4aQ8VEJ9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps4aQ8VEJ9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps4aQ8VEJ9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps4aQ8VEJ9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps4aQ8VEJ9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps4aQ8VEJ9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps4aQ8VEJ9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps4aQ8VEJ9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps4aQ8VEJ9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps4aQ8VEJ9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps4aQ8VEJ9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps4aQ8VEJ9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps4aQ8VEJ9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vps4aQ8VEJ9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps4aQ8VEJ9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vps4aQ8VEJ9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms