Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Smg8Q8VE18 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Smg8Q8VE18 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Smg8Q8VE18 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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Smg8Q8VE18 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Smg8Q8VE18 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Smg8Q8VE18 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Smg8Q8VE18 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Smg8Q8VE18 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg8Q8VE18 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Smg8Q8VE18 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Smg8Q8VE18 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Smg8Q8VE18 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms