Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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