Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ssx2ipQ8VC66 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx2ipQ8VC66 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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