Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4K2

Irak4, Interleukin-1 receptor-associated kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irak4Q8R4K2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irak4Q8R4K2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irak4Q8R4K2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irak4Q8R4K2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irak4Q8R4K2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irak4Q8R4K2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irak4Q8R4K2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irak4Q8R4K2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irak4Q8R4K2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irak4Q8R4K2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irak4Q8R4K2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irak4Q8R4K2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms