Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc58Q8R3Q6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ccdc58Q8R3Q6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ccdc58Q8R3Q6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ccdc58Q8R3Q6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ccdc58Q8R3Q6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ccdc58Q8R3Q6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ccdc58Q8R3Q6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ccdc58Q8R3Q6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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