Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CipcQ8R0W1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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