Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms