Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MyripQ8K3I4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MyripQ8K3I4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms