Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R3

Pnpt1, Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpt1Q8K1R3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnpt1Q8K1R3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms