Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp27Q8K194 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms