Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Znf628Q8CJ78 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Znf628Q8CJ78 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Znf628Q8CJ78 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Znf628Q8CJ78 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Znf628Q8CJ78 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Znf628Q8CJ78 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Znf628Q8CJ78 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Znf628Q8CJ78 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Znf628Q8CJ78 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Znf628Q8CJ78 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms