Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms