Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms