Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc63Q8CDV6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms