Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms