Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcinQ8CDE2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms