Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd4aQ8CBY1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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