Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ubqln3Q8C5U9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ubqln3Q8C5U9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ubqln3Q8C5U9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ubqln3Q8C5U9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ubqln3Q8C5U9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ubqln3Q8C5U9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ubqln3Q8C5U9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ubqln3Q8C5U9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ubqln3Q8C5U9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ubqln3Q8C5U9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ubqln3Q8C5U9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ubqln3Q8C5U9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ubqln3Q8C5U9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubqln3Q8C5U9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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