Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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