Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C1R3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms