Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms