Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp5Q8BX09 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms