Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TtpaQ8BWP5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtpaQ8BWP5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms