Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rufy1Q8BIJ7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms