Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smndc1Q8BGT7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smndc1Q8BGT7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms