Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms