Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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ChfrQ810L3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms