Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Amigo1Q80ZD8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Amigo1Q80ZD8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Amigo1Q80ZD8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Amigo1Q80ZD8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Amigo1Q80ZD8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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