Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Pcsk9Q80W65 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk9Q80W65 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk9Q80W65 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Pcsk9Q80W65 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Pcsk9Q80W65 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Pcsk9Q80W65 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Pcsk9Q80W65 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Pcsk9Q80W65 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Pcsk9Q80W65 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Pcsk9Q80W65 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Pcsk9Q80W65 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Pcsk9Q80W65 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Pcsk9Q80W65 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pcsk9Q80W65 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pcsk9Q80W65 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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